在处理纠纷时，需要一定的证据来支持自己的观点和看法，所以一旦发生，第一时间保存和收集证据是非常重要的。目前检查单据一般由医院保管，所以发生纠纷后，患者比较被动。一般来说，证据包括病历、化验单、处方和药品、输血和输血残留物、手术切除组织等能够证明医疗过程真实情况的材料。
(一)患者的病历
患者的病历，包括门诊病历和住院病历，是患者就诊的最原始的证据材料。医生记录患者主诉的基本情况，其体检情况，诊疗意见和处方。003010明确规定，医疗机构应当按照国务院卫生行政部门规定的要求书写并妥善保存病历。因抢救危重患者未及时书写病历的，相关医务人员应当在抢救后6小时内进行事实补充，并予以注明。严禁涂改、伪造、隐匿、销毁、抢夺病历资料。患者有权复印或者复制其门诊病历、住院病历、体温单、医嘱单、实验室检查(检验报告)、医学影像检查资料、特殊检查同意书、手术和麻醉记录、病理资料、护理记录以及国务院卫生行政部门规定的其他病历资料。患者要求复印或者复制病历资料的，医疗机构应当提供复印或者复制服务，并在复印或者复制的病历资料上加盖认证标志。复印或者复制病历时，应当有患者在场。
(2)检验单
检查清单包括各种实验室检查和医疗器械的检查结果。目前，随着医学检测手段的发展，医生的诊断越来越依赖于各种检测和医疗仪器。这些检验结果是非常重要的个人资料，忽视检验结果反映的异常情况，或者未能发现疾病，造成漏诊、误诊，医院是有责任的。
(3)处方和药物
目前医院一般会给患者发一份处方复印件，患者要注意保存。除此之外，毒品和毒品包装袋也是重要证据。处方可以反映医生是否用错了药，剩余药品和包装袋可以反映药房或护士是否给错了药。
(4)输血用残液或包装袋。
输血在临床上很容易导致患者的不良反应。一旦患者出现不良反应或医疗纠纷，患者应注意保存好输液残液或其包装袋，以便日后送相关部门检查。
此外，手术患者的组织切除也是处理医疗纠纷的有利证据。
如遇输液、输血、注射、药物等引起的疑似不良后果。医患双方应当共同对现场进行密封和启封。