医疗纠纷索赔案件的诉讼时效是一年，那么从什么时候开始呢？第37条第10条规定：“诉讼时效从知道或者应当知道权利被侵害的时候起计算。但是，从被侵权之日起超过二十年的，人民法院将给予保护。”所谓明知权利被侵害，是指客观上存在明知的条件和可能性。无论当事人是否实际知道，都推定其知道权利被侵害，时效期间应从此时起计算。
例如，1993年，无名氏的一个病人在A医院分娩时因大出血输了200毫升血，5个月后在B医院确诊为B型炎症，当时的病例中记录了这次输血史，并注明了乙肝的病因。患者一直在B医院治疗，从未到A医院申报过此情况。1996年初，由于单位医疗制度改革，病人要承担一部分医疗费用。此时，患者向法院提起诉讼，要求甲医院承担这部分医疗费用，并声明自己刚刚得知乙肝与输血有关。法院开始受理此案，并通知了第一医院。甲医院法律顾问及时向法院提出本安已超过诉讼时效的分析意见，法院驳回了钱媛的诉讼请求。
为了保证权利人在特殊情况下仍有必要的时间行使诉讼权利，法律还规定了诉讼时效的中止。 第139条规定：“在诉讼时效的最后六个月内，因不可抗力或者其他障碍不能行使请求权的，诉讼时效中止。自中止时效期间的原因消除之日起，时效期间继续计算。”
比如在得出鉴定结论后的第11个月，一个医疗事故的残疾患者在家乡山区突发疾病，交通中断，无法到县法院起诉。两个月后，洪水退去。这个期间是诉讼时效的中止期间。自交通恢复后，一个月的诉讼时效继续失效。这个所谓的不可抗力。
再比如，一个5岁的小女孩右腿股骨骨折，在医院手术复位。由于技术原因，术中和术后处理不当，导致成角畸形愈合，严重影响了她的右腿功能。她被鉴定为二级医疗事故。不久后，女孩唯一的亲人，她的母亲，因病住院，8个月后去世。女孩在人民政府部门和邻居的照顾下，历经一年多的艰辛，被送到了儿童福利院。得知女孩的情况后，福利院作为法定代表人立即向法院提起诉讼，要求医院赔偿。这个案子从鉴定到起诉用了两年零四个月，但是法院不仅受理了，最后还判决福利院和女孩胜诉。即所谓的其他障碍不能行使请求权。从女孩母亲死亡到福利院了解事故发生的期间，属于诉讼时效中止。